□记者 薄克国 通讯员 刘 洋 报道
本报青岛讯 中国科学院海洋研究所日前在青岛宣布,我国科学家国际上首次完成仿刺参基因组测序和组装,开启了刺参生物学和遗传育种研究的新时代。
该成果由中国科学院海洋研究所杨红生研究员团队和相建海研究员团队共同完成,在天津生物芯片技术公司的技术支撑下,突破了刺参复杂基因组测序和组装技术瓶颈,采用新一代测序技术获得132Gb高质量DNA序列数据,覆盖全基因组160倍。科研人员利用针对高复杂度基因组组装的创新策略,在国际上首次成功完成了野生刺参的基因组组装,目前获得的框架图总长度达到765Mb,组装叠连群Contig N50达112Kb,该数值优于国际迄今已发表的多数水产动物基因组图谱的指标。初步检测表明,功能基因区覆盖达95%以上。
“经过基因组探查,仿刺参基因组属高杂合度复杂基因组。”相建海研究员介绍,仿刺参基因组的测序和组装,将为刺参的繁殖发育、免疫调控、营养代谢、遗传解析提供重要理论支撑。下一步将整合科研团队力量,进行刺参重要经济性状解析、分子标记辅助选育和全基因组遗传育种研究,开展揭示刺参的夏眠、再生、自溶等特殊生命现象的机理机制等相关研究,为我国刺参产业健康可持续发展提供有力科技支撑。
本报青岛讯 中国科学院海洋研究所日前在青岛宣布,我国科学家国际上首次完成仿刺参基因组测序和组装,开启了刺参生物学和遗传育种研究的新时代。
该成果由中国科学院海洋研究所杨红生研究员团队和相建海研究员团队共同完成,在天津生物芯片技术公司的技术支撑下,突破了刺参复杂基因组测序和组装技术瓶颈,采用新一代测序技术获得132Gb高质量DNA序列数据,覆盖全基因组160倍。科研人员利用针对高复杂度基因组组装的创新策略,在国际上首次成功完成了野生刺参的基因组组装,目前获得的框架图总长度达到765Mb,组装叠连群Contig N50达112Kb,该数值优于国际迄今已发表的多数水产动物基因组图谱的指标。初步检测表明,功能基因区覆盖达95%以上。
“经过基因组探查,仿刺参基因组属高杂合度复杂基因组。”相建海研究员介绍,仿刺参基因组的测序和组装,将为刺参的繁殖发育、免疫调控、营养代谢、遗传解析提供重要理论支撑。下一步将整合科研团队力量,进行刺参重要经济性状解析、分子标记辅助选育和全基因组遗传育种研究,开展揭示刺参的夏眠、再生、自溶等特殊生命现象的机理机制等相关研究,为我国刺参产业健康可持续发展提供有力科技支撑。